学院于1991年设立淡水渔业专业，1999年更名为水产养殖学，是甘肃农业大学近年来重点建设的特色本科专业。

本专业以立德树人为根本，以现代渔业发展对人才、技术的需求为导向，形成“产学研”紧密结合、地域契合度高的办学特色，初步构建“本科-硕士-博士”一体化人才培养体系，培养更多知农爱农的拔尖创新型人才。学生通过水产生物增养殖基本理论、基本知识和基本技能学习，熟悉水产动物生产和疫病防治的重要环节，具备水产动物增养殖、疾病诊断与防治、水产饲料及渔药开发、鱼类资源保护及渔业水质监测、渔业经营管理等方面的基本能力，能在水产养殖相关领域和部门从事生产管理、教学科研、技术推广、创新创业等工作。