甘肃省牛羊基因改良工程实验室是2012年甘肃省发展与改革委员会批准、依托甘肃农业大学建设和执行的省级工程实验室。新西兰林肯大学基因标记实验室、兰州庄园牧场股份有限公司、甘肃育耕牧业科技有限公司等企业共同参加建设和实施。该实验室是在甘肃省草食动物生物技术重点实验室基础上，针对甘肃省牛羊产业发展的重大需求，重点开展牛羊基因改良共性技术和关键技术试验研究、制订产业技术标准、培养技术创新人才、促进科技成果转化、提供社会服务等。工程实验室属于产学研结合为主要方式的研究实体，为实现牛羊产业发展技术的高水平、专业化和商业化服务。实验室的技术研发方向有功能基因分子标记与育种、肉奶质量分子追溯与检测和奶牛DHI改良三个方面。