动物科学技术学院前身为1950年4月创建的国立兽医学院畜牧专业。随后成立畜牧系，并先后更名为动物生产工程系（1993年9月）、动物科学技术系（1999年7月）和动物科学技术学院(2001年3月)。
是我国高等农业院校中办学历史较长，并在国内外畜牧学界有广泛影响的学院，是我国畜牧高级专业人才培养和科学研究的重要基地。2001年经国家人事部批准设立畜牧学博士后科研流动站。2003年获批畜牧学-级学科，具有农业(畜牧领域)硕士专业学位授予权。建有西北地区肉羊肉牛遗传改良国际科技合作基地等6个国家级、省部级科研平台。学院设动物科学、动物科学(畜牧兽医方向)、水产养殖学3个本科专业方向，其中动物科学专业一本招生，学校应用技术学院招收动物科学专业三校生。
其中动物科学专业1949年开始招收本科生，2012年评为甘肃省高等学校特色专业，2018年被甘肃农业大学列为重点支持建设的一流本科专业。2020年教育部公布了首批一流本科专业建设“双万计划”名单，我院动物科学专业，获批建设国家级一流本科专业点。
学院现开设动物科学、动物科学（含畜牧兽医方向）、水产养殖学 3 个本科专业和自学考试应用型独立本科段（专升本）动物科学专业，在学校应用技术学院招收动物科学专业（三校生）。学院现有4个系（动物遗传育种与繁殖系、动物营养与饲料科学系、动物生产与管理系和水产养殖系）、1个动物科学省级实验教学示范中心（遗传育种与繁殖实验室、动物营养实验室、动物生产实验室、水产实验室及动物科学校内实训中心）。畜牧学一级学科于 2003 年经国务院学位办批准为博士学位授权点，下设4个二级学科博士点（动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、特种经济动物饲养、动物生产学）。畜牧学一级学科设博士后科研流动站（ 2001 年被国家人事部批准设立）。动物遗传育种与繁殖为农业部和甘肃省重点学科，动物营养与生产学为甘肃省重点学科。学院具有农业推广（养殖领域）硕士专业学位授予权。
学院现有教职工 59人，其中教授14人，副高职称教师（副教授、副研究员、高级实验师）18 人，中级职称教师（讲师、实验师、助理研究员）17人。博士生导师 10人，硕士生导师25人。有10余位教师荣获国家级、省级荣誉称号， 6位教师享受政府特殊津贴， 2位教授为甘肃省优秀专家。全国农业推广专业学位养殖领域协作组长1人， 6名教师入选甘肃省 “ 333 ” 、 “ 555 ” 人才工程。在全国学术团体任理事以上职务10余人。70余年来，学院已为社会培养各类专业人才11426人，其中博士研究生126人，硕士研究生761人，本科生4865人，专科生1133人，成人及自考本科生4514人。毕业生遍及海内外，涌现出如英国皇家科学院院士等大批专家学者和企业家。近几年，研究生及本科生考研率、就业率位居全校各专业前列。截止2020年6月，学院有各类在读学生1207人，其中，博士研究生43人，硕士研究生156人，本科生1008人。
学院围绕国家和地方经济发展中的重大科技问题开展了广泛的科学研究。60多年来，学院广大教师以严谨的治学态度和勤奋求实的精神，取得了显著的教学、科研成果。获得教学科研成果114项，发表学术论文1000余篇，主编、参编出版教材、著作100多部。